知网查重自我重复的原因主要包括：1.文章结构相似度高，导致系统误判；2.引用格式不规范，被系统识别为自我抄袭；3.文章内容模板化，容易被查重系统检测出相似度。

另外，知网查重系统也会受到文本长度、词汇重复、语义相似度等因素的影响，进而出现自我重复的情况。为避免自我重复，作者在写作时应注意避免模板化表达、规范引用格式、提高文章结构差异性等。